王自健八十年代中生于北京，爸爸媽媽雙職工，爸爸是做建筑的。
在人大附小上學時，他一直堅持不寫作業，因為他認為不寫作業成績一樣挺好。
高中時就寫槍稿，當會兒幫幾家游戲廠商在《家用電腦與游戲機》和《軟件與光盤》上寫軟文，千字稿費100至200元。若為游戲攢出一本攻略書，收入則有四千到五千。考大學的時候，因為當時跟高中置氣退學，然后自己去街道報名高考，等于是高二就去考了，而且考上了，而且是個名校，但是沒有辦法學自己想學的東西。王自健偏理科，但為參加高考，他選擇讀文，討巧在自己背書快。
畢業后，因為喜歡打游戲，畢業后到電視臺為游戲類節目寫稿子，漸漸開始做編導。在北京電視圈摸爬滾打多年后，他又投身于廣告界，從創意到文案撰寫等等。
2007年，在北京師范大學禮堂。王自健和搭檔說了一段傳統相聲《打燈謎》。
2009年，王自健辭掉工作，成了一名專職相聲演員。一年后成立了“相聲第二班”，每周末下午在北京小劇場說相聲，“場場爆滿”。
2010年，摯友被收購，王自健成立自己的相聲團體“北京第二班相聲大會”。10月1日王自健受邀在東方衛視新欄目《今晚，80后說相聲》中亮相，與搭檔陳朔說了一段改良版相聲《精裝賣掛票》。
2011年4月，在“相聲第二班”的一場常規演出中，王自健說了相聲《歪唱太平歌詞》。98分鐘的演出里，高漲的油價、房價，卡扎菲，都成了他揶揄的對象。“歪唱”視頻在網絡飛速傳播。同年拜在侯耀華先生門下。
2012年5月13日，《今晚，80后脫口秀》首秀。黑人DJ打碟開場，王自健黑色西裝蝴蝶領結登場。那場脫口秀時長40分鐘，話題是吐槽“80后”面對的“困境”。
2014年BTV春晚上，王自健表演相聲《最貴的鐵器是北京市車牌子》。8月11日，王自健通過微博宣布自己正式進軍手機界。
2015年王自健參演的電影《咱們結婚吧》于4月2日上映。